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原位杂交精华版

2022-06-19 来源:客趣旅游网
原位杂交 第一部分

1. 2. 3. 4. 5.

用酒精棉擦干净展片台,升温到50℃。 从-70℃冰箱取出切片,将切片放到展片台上,烘片5min(目的是避免切片形成液滴)。 在切片上滴加4% PFA固定切片1h。。 在染缸中,用1×PBS洗涤,5min/次×2次。 在切片上滴加1% Triton—X100透膜20min。 此期间配预杂交液和杂交液 6. 在染缸中,用1×PBS洗涤,5min/次×3次。

7. 预杂交:在切片上滴加预杂交液(20~100μL/片,视组织的大小而定),要均匀的覆盖在

组织上,室温下在湿盒中静置15min。湿盒是在盒底盛装了预杂交液等渗液的离心管盒。确认盒底等渗液。 8. 杂交:将探针在85℃ PCR仪变性3min后,立即放回冰上静置1min(因此需要在实验开

始时制冰;或者是将铝盒盛装一些水敞口放在-20℃,1h左右即可结冰,并可一直保存)。探针变性后,加到杂交液中,滴加20~50μL/片于切片上,可以选择加盖盖玻片,在湿盒中55℃静置过夜。

严格操作,以防RNA降解。

第二部分

1. 开启水浴锅,设定为55℃,预热。配制

5×SSC(50% 甲酰胺)2份, 2×SSC(50% 甲酰胺)1份, 0.2×SSC(50% 甲酰胺)2份, 0.2×SSC(H2O)1份。

前5个染缸用PE手套套上,放入水浴锅预热洗涤液15min;最后一个在室温放置。 2. 将切片从湿盒取出倾掉杂交液,洗涤:

5×SSC(50% 甲酰胺),55℃,5min; 5×SSC(50% 甲酰胺),55℃,15min; 2×SSC(50% 甲酰胺),55℃,30min; 0.2×SSC(50% 甲酰胺),55℃,30min; 0.2×SSC(50% 甲酰胺),55℃,30min。 3. 0.2×SSC(H2O),室温,5min,去除甲酰胺。 4. 在Buffer1中平衡5min。

5. 将切片放入湿盒,滴加Blocking Solution,确认盒底等渗液,室温封闭1h。 6. 滴加抗体,湿盒中4℃过夜,或室温孵育30min~4h。

第三部分

1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8.

用Buffer1洗涤,5min/次×3次。 用Buffer2平衡,5min。

在切片上滴加显色液,室温显色12h。

经常在显微镜下观察显色情况,以保证适当显色,通常2h~16h。 用灭菌水冲洗干净。

在切片上滴加甲基绿对染,5min。

用灭菌水冲洗干净,直至流下的水无色。 加水或甘油封片,拍照。

附录

1. 实验用品准备:

(1) 载玻片:用铬酸浸泡24h,自来水冲洗,蒸馏水冲洗,95%酒精浸泡24h,纱布擦

干净,180℃干热灭菌6h以上,2% APES丙酮溶液处理5min,丙酮洗涤5min,灭菌水涮洗2次,烘干备用。 (2) 玻片盒,湿盒:用自来水冲洗,蒸馏水冲洗,100mL 3%双氧水消毒灭菌,55℃烘

箱中烘干,切勿试图湿热灭菌,否则玻片盒会损坏,湿盒会略有变形。 (3) 几个200~500mL的烧杯,10mL、50mL、100mL的量筒,几个100mL的细口瓶

(磨砂盖),3个组织镊,180℃干热灭菌6h以上。 (4) 盖玻片用95%酒精浸泡,纱布擦干净,180℃干热灭菌6h以上 (5) 滤纸:5cm×5cm,几十张,边缘要切整齐,。

(6) 枪头:用超声波清洗器处理3次,15min/次。之后将其中一部分再用0.01% DEPC水浸泡过夜。所有枪头121℃湿热灭菌15min。 (7) DEPC水:0.1%的DEPC水溶液,121℃湿热灭菌30 min。 (8) 灭菌水:蒸馏水121℃湿热灭菌15min。

2. 10×PBS:NaCl 8.18g(1.4M),KCl 0.2g(27mM),Na2HPO4·12H2O 3.58g(100mM),KH2PO4 0.245g(18mM),100mL H2O,PH7.4,高压灭菌,4℃保存。 使用前55℃预热,以使析出结晶溶解。 3. 1×PBS:一次实验用量为150~200mL。用DEPC水稀释10×PBS到1×即可。 4. 4% PFA:1×PBS 20mL,PFA粉末0.8g,在磁力搅拌器上55~60℃加热搅拌直至完全溶解,滤器过滤除菌除杂质,分装为1mL/tube,-20℃冻存。 5. 1% Triton-X100:1×PBS 20mL,TritonX-100 200μL,在磁力搅拌器上55~60℃加热搅

拌直至完全溶解。Triton-X100很粘稠,需用1mL的枪头吸取,按到第二档吸取,按到第一档打出即可;或者用第一档缓慢吸取,第二档打出。 6. 20×SSC:NaCl 17.53g(3M),柠檬酸三钠8.82g(0.3M),100mL H2O,用几滴浓盐酸

调pH至7.0。杂交前的用DEPC水溶解,过滤分装,室温保存;杂交后的用蒸馏水溶解,灭菌,室温保存。 7. 预杂交液:5×SSC(50%去离子甲酰胺),每1mL中加250μL 20×SSC,250μL DEPC水,

500μL去离子甲酰胺,20μL 1% BSA(终浓度0.02%)。临用前每0.5mL预杂交液中加入2.5μL 50mg/mL tRNA(终浓度0.25μg/μL)。对于6张切片来说,通常需要配置1mL预杂交液,为杂交液准备0.5mL。杂交用的湿盒盒底的等渗液为40mL,组分为10mL 20×SSC(灭菌水配制),10mL灭菌水,20mL甲酰胺。 8. 杂交液:0.5mL预杂交液中加硫酸葡聚糖0.05g(终浓度10%),置于55℃烘箱溶解均匀,临用前加入2.5μL 50mg/mL tRNA(终浓度0.25μg/μL)。每100μL杂交液加入一支探针(5~10μL,85℃变性3min后置冰水混合物骤冷1min,终浓度为200~500ng/mL)。 注意,杂交液一半不加探针,阴性对照需要。

9. 1M TrisCl(100mL):12.1g,pH 7.5和9.5各一份,80mL蒸馏水溶解,用浓盐酸调pH,

定容至100mL; 5M NaCl(100mL):29.2g,用80mL蒸馏水溶解,定容至100mL; 1M MgCl2(100mL):20.33g MgCl2·6H2O,用40mL蒸馏水溶解,定容至100mL。 灭菌,常温保存。 10. Buffer1(100mL):1M TrisCl,pH7.5,10mL;5M NaCl,3mL。蒸馏水定容至100mL。

Buffer2(40mL):1M TrisCl,pH9.5,4mL;5M NaCl,0.8mL;1M MgCl2,2mL。蒸馏水定容至100mL。

Buffer现用现配,蒸馏水配制,室温保存。 11. Blocking Solution:1%(w/v),称取0.1g Blocking Reagent到小烧杯,加入10mL Buffer1,

放入转子,在磁力搅拌器上以中速搅拌并加热,不要使溶液沸腾(50~60℃)。冷却后分装为1mL/tube,-20℃长期保存,4℃短暂保存。4℃久置会出现沉淀,振荡混匀即可。 12. Antibody Solution:抗体贮存液为抗体原液用无菌的Buffer1 1:25稀释,4℃保存。抗体工作液为贮存液1:200溶于1% Blocking Solution,即抗体的终浓度浓度为1:5000。1mL抗体工作液中加5μL抗体贮存液。 13. 显色液:NBT 4.5μL,BCIP 3.5μL,左旋咪唑5μL,溶于1mL Buffer2中。

NBT:黄色粉末,贮存液浓度为75mg/mL,用70% DMF(即N,N-二甲基甲酰胺)配制。使用终浓度为0.3375mg/mL。

BCIP:白色粉末,贮存液浓度为50mg/mL,用纯DMF配制。使用终浓度为0.175mg/mL。

左旋咪唑:贮存液为2M,用蒸馏水配制。使用时先稀释为0.2M,用Buffer2(或蒸馏水)配制,48mg/mL。使用的终浓度为1mM。

14. 对染液:NaAc·3H2O 1.36g加蒸馏水90mL,用冰乙酸调节pH至4.2,补加蒸馏水至

100mL,加入0.50g甲基绿,氯仿抽提3次以上直至下层无色,去除甲基紫,分离水相备用。在反复抽提中,可能会出现分层不彻底的现象,更换干净的烧杯即可。

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